'Lihhenoloogia töörühm'
HistoryEdited Today at 3:51 AM by Unknown User…

Kristiina Mark: 16


MSc, doktorant

Tartu Ülikool, Ökoloogia ja Maateaduste Instituut, botaanika osakond

Lai 38, 51005, Tartu

Tel: 737 6266 (6266); e-mail: kristiina.mark@ut.ee


Vt ka CV-d ja publikatsioonide loendit ETIS-es.


Oma lihhenoloogia teekonda alustasin bakalaureuseõppes ning selle lõppedes kaitsesin Andres Saagi ning Lauri Saagi juhendamisel bakalaureusetöö "Liigikontseptsioonid ning -kriteeriumid mittesuguliste lihheniseerunud seente süstemaatikas perekonna Lepraria näitel". 2011. a. kevadel kaitsesin magistritöö teemal "Lihheniseerunud seeneliikide Vulpicida juniperinus ja V. tubulosus (Parmeliaceae, Ascomycota) eristamine DNA tunnuste alusel" (juhendaja vanemteadur Lauri Saag).

Doktoriprojektis jätkan lihheniseerunud seente taksonoomia uurimist sugukonnas Parmeliaceae. Just sugukonnas Parmeliaceae on mitmed sugulussuhted jäänud lahenduseta ning perekondade ning liikide piiritlemine on ebajärjekindel. Kasutades peamiselt molekulaarseid, aga ka morfoloogilisi ning keemilisi tunnuseid, on uurimisfookuses kolm Parmeliaceae perekonda - Vulpicida (rebasesamblik), Usnea (habesamblik) ning Cetrelia (helksamblik). Tegemist on laialt levinud suursamblikega ning mitmed liigid on olulised nii ökoloogilistes kui bioindikatsioonilistes uuringutes. Adekvaatne taksonoomiline informatsioon võimaldab neid liike täpsemalt kasutada erinevates rakenduslikes uuringutes; molekulaarsed tunnused lubavad uurida üldisemalt evolutsiooni kulgu ning liikide kujunemist.


Valik publikatsioone

Mark, K., Cornejo, C., Keller, C., Flück, D., & Scheidegger, C. (2016). Barcoding lichen-forming fungi using 454 pyrosequencing is challenged by artifactual and biological sequence variation. Genome, doi:10.1139/gen-2015-0189.

Mark, K., Saag, L., Leavitt, S. D., Will-Wolf, S., Nelsen, M. P., Tõrra, T., Saag, A., Randlane, T., and Lumbsch, H. T. (2016). Evaluation of traditionally circumscribed species in the lichen-forming genus Usnea, section Usnea (Parmeliaceae, Ascomycota) using a six-locus dataset. Organisms Diversity & Evolution, doi:10.1007/s13127-016-0273-7.

Saag, L.; Mark, K.; Saag, A.; Randlane, T. (2014). Species delimitation in the lichenized fungal genus Vulpicida (Parmeliaceae, Ascomycota) using gene concatenation and coalescent-based species tree approaches. American Journal of Botany 101(12): 2169-82.

Mark, K., Saag, L., Saag, A. Thell, A. & Randlane, T. (2012). Testing morphology-based delimitation of Vulpicida juniperinus and V. tubulosus (Parmeliaceae) using three molecular markers. The Lichenologist 44(6): 757-772.

Saag, Lauri; Mark, Kristiina; Saag, Andres; Thell, Arne; Randlane, Tiina (2012). Phylogeny of the genus Vulpicida and delimitation of the species. In: Lichens: from genome to ecosystems in a changing world: The 7th IAL Symposium; 09.-13.01.12 Thailand. , 2012, 33 - 33.

Comments

listPõhiteemad wikisteemad-estteemad-est5urlSamblike infosüsteemeseis-esteSEIShttp://www.eseis.ut.eeeSEISurlÕppe-, teadus- ja tehnilised töötajadinimesed-I-estInimesed - töötajad/groups/et/search/?sort=title&kind=wiki&sortDirection=forward&tag=töötajadInimesed - töötajadurlDoktorandid ja magistrandidinimesed-II-estInimesed - kraadiõppurid/groups/et/search/?sort=title&kind=wiki&sortDirection=forward&tag=doktorandidInimesed - kraadiõppuridurlTeadus- ja rakendustegevus; projektid; populariseerimineteadus-estTeadus/groups/et/search/?sort=title&kind=wiki&sortDirection=forward&tag=teadusTeadusurlTeadus ja õpe; teemad tudengiteleope-estÕpe/groups/et/search/?sort=title&kind=wiki&sortDirection=forward&tag=õpeÕpe/groups/et/search/index.rss?sort=createdDate&kind=weblog&sortDirection=reverselist/groups/et/search/?sort=createdDate&kind=weblog&sortDirection=reverseUudised blogisUudisedBlogisUudisedBlogis?sort=createdDate&kind=weblog&sortDirection=reverse0/groups/et/sidebar/UudisedBlogiscreatedDateweblog3UudisedBlogisreverseUudised blogissearchsearch/groups/et/search/index.rss?sort=modifiedDate&kind=wiki&kind=weblog&kind=mailinglist&sortDirection=reverselist/groups/et/search/?sort=modifiedDate&kind=wiki&kind=weblog&kind=mailinglist&sortDirection=reverseViimati muudetudRecentAddsListRecentAddsList?sort=modifiedDate&kind=wiki&kind=weblog&kind=mailinglist&sortDirection=reverse0/groups/et/sidebar/RecentAddsListmodifiedDatewikiweblogmailinglist3RecentAddsListreverseViimati muudetudsearchsearch